Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms