Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPAQ06546 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms