Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms