Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms