Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms