Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms