Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms