Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms