Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42P60953 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms