Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms