Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME5P56597 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME5P56597 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms