Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms