Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF135P52742 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms