Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms