Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms