Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms