Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT9P35527 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT9P35527 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT9P35527 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms