Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms