Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN1P31025 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN1P31025 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LCN1P31025 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN1P31025 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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