Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms