Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms