Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms