Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPREP23469 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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