Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM21P19474 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms