Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms