Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf89P0DMQ9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms