Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP2O95045 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP2O95045 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP2O95045 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms