Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms