Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PPFIA3O75145 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PPFIA3O75145 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms