Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOFO60613 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms