Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB3O43889 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB3O43889 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms