Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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