Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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