Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms