Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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