Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms