Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms