Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms