Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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