Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms