Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms