Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms