Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGXB4Q9UGU5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms