Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms