Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms