Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM8A1Q9UBU6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms