Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms