Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms