Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms