Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms